Hay muchos motivos.
Lo principal es que apesar de ser una de las protagonistas nunca hace nada.(la pelea contra sasori no cuenta porque chiyo era la que hacia todo el trabajo, sakura era una mera herramienta)
Tambien tenes:
Entreno con uno de los Sannin pero su poder no es nada cercano al del resto de sus compañeros.
Se la pasa maltratando a Naruto.(si no haces nada por lo menos quedate callada, viste)
Se paso la primera mitad del manga babeando por sasuke (y la otra mitad, un poco tambien)
Tiene indicios de ser Bi-polar.(o algun trastorno mental parecido, por esa sakura interna que tiene y sus constantes cambios de humor repentinos.)
Su utilidad en batalla hasta ahora, fue practicamente nula.(exeptuando curar, y tampoco es una pro.)
Y la peor de todas, fue la supuesta confesión. Manipular los sentimientos de esa forma a un amigo es lo mas bajo que puede hacer cualquier persona.
Este fue uno de los golpes mas bajos, que logro un repudio por gran parte de los lectores.
Me abstengo de hablar del fisico, puesto que el gusto varia de persona en persona. (aclaro que no me parece linda, pero a otros si)