Pues primero lo primero, un pokemon para dormirlo sería bueno, si no tienes un pokemon con Falso tortazo, bájale lo mas que puedas y luego duermelo o paralizalo.
Sería mejor que tengas mas ultraballs y otras tipo de balls y guarda antes de confrontarlo, puedes derrotarlo si quieres, pero si lo quieres capturar, guarda por si lo derrotas y vuelves a iniciar la batalla.
Como te dicen arriba, compra para subir tu sangre ya que te bajara mucha, recupera a tus pokemon y no te desesperes
Y espero que tengas el suficiente nivel con tus pokemon, porque tiene nivel 50 no? no te puedo decir mas cosas, suerte y capturalo si puedes
PD: No gastes tu Master Ball en el, espera mas para usarla, en Mewtwo como dices.